DNA探針(DNA probe)是**常用的核酸探針,為長度在幾十到幾百甚至上千堿基對的單鏈或雙鏈DNA,用特殊示蹤劑(如同位素、酶或有色基團)進行標記;在適當的pH值、溫度和離子強度下,DNA探針利用分子的變性、復性以及堿基互補配對的高度精確性,能與待測樣本中互補的非標記單鏈DNA或RNA以氫鍵結合(雜交),形成雙鏈復合物(雜交體)。雜交體的穩定性取決于兩條單鏈核苷酸之間的互補程度。在嚴格的條件下(高pH值、高溫、低離子強度),不完全匹配的雜交體的兩鏈將會解離,而完全匹配的雜交體將保持雙鏈。將未配對結合的探針洗去后,可用放射自顯影或酶聯反應等檢測系統檢測雜交反應結果。電子探針在鏡筒部分與掃描電鏡明顯不同之處是由光學顯微鏡。徐匯區挑選探針推薦貨源
探針DNA克隆的篩選也可采用血清學方法,所不同的是所建DNA文庫為可表達性,克隆菌落或噬斑經裂解后釋放出表達抗原,然后用來源細菌的多克隆抗血清篩選陽性克隆,所得到多個陽性克隆再經其它細菌的抗血清篩選,***只與本細菌抗血清反應的表達克隆即含有此細菌的特異性基因片段,它所編碼的蛋白是該菌種所特有的。用這種表達文庫篩選得到的顯然只是特定基因探針。對于基因探針的克隆尚有更快捷的途徑。這也是許多重要蛋白質的編碼基因的克隆方法。該方法的第一步是分離純化蛋白質,然后測定該蛋白的氨基或羥基末端的部分氨基酸序列,然后根據這一序列合成一套寡核苷酸探針。楊浦區挑選探針按需定制為此,一般也采用鎢絲熱發射電子槍和2-3個聚光鏡的結構。
特異性探針有三種形式——cDNA、RNA、寡核苷酸。cDNA和寡核苷酸是**常采用的探針。RNA探針用途很廣,也容易獲得,但其不穩定性限制了其商業用途。cDNA探針的獲得是,將特定的基因片段裝載到質粒或噬菌體中,經過擴增、酶切、純化等復雜的步驟,才能得到一定長度的cDNA探針。這一過程比較復雜,有相應條件的實驗室才能做到。寡核苷酸探針是在已知基因序列的情況下,由核酸合成儀來完成,可廉價獲得大量的此類探針。質量也相對來說更為穩定。由于cDNA探針長度通常為數百至數千個堿基,所以有良好的信號放大作用,但其滲透性比較差。寡核苷酸探針一般為十數個至數十個堿基,滲透性強,但信號放大作用則較差,合成的多相寡核苷酸探針,敏感性可以達到cDNA探針水平。
在原核表達系統中外源基因不僅進行正向轉錄,有時還存在反向轉錄(即生成反義RNA),這種現象往往是外源基因表達不高的重要原因。另外,在真核系統,某些基因也存在反向轉錄,產生反義RNA,參與自身表達的調控。在這些情況下,要準確測定正向和反向轉錄水平就不能用雙鏈DNA探針,而只能用RNA探針或單鏈DNA探針。探針是能與特異靶分子反應并帶有供反應后檢測的合適標記物的分子。利用核苷酸堿基順序互補的原理,用特異的基因探針即識別特異堿基序列的有標記的一段單鏈DNA(或RNA)分子,與被測定的靶序列互補,以檢測被測靶序列的技術叫核酸探針技術。探針制備就是將目的基因進行標記。只要令探測器連續進行2θ角的掃描,即可在整個元素范圍內實現連續測量。
②隨機引物法。隨機引物是指含有各種可能排列順序的寡聚核苷酸片斷的混合物,因此它可以與任意核苷酸序列雜交,起到聚合酶反應的引物作用。將待標記的DNA探針片斷變性后與隨機引物一起雜交,然后以此雜交的寡聚核苷酸為引物,在大腸桿菌DNA聚合酶I大斷段(KlenowFragment)催化下,合成與探針DNA互補的DNA鏈,當在反應體系中含有a-32P-dNTP時,即形成放射性同位素標記的DNA探針。具有上述優點,可代替缺口平移法。此外大小、單雙DNA均可標記,標記均勻,標記率高,但也不能標記環狀DNA。隨機引物法標記探針一般長400~600bp。電子探針又稱微區X射線光譜分析儀、X射線顯微分析儀。金山區優勢探針推薦貨源
分析元素從原子序數3(鋰)至92(鈾)。感量可達10-14至10-15g。徐匯區挑選探針推薦貨源
DNA探針根據其來源分為3種:一種來源于基因組中的基因本身,稱為基因組探針(genomic probe),可以是基因的全序列,或者基因上的一段序列;另一種是從相應的基因經轉錄獲得mRNA,再通過逆轉錄得到的探針,稱為cDNA探針(cDNA probe);此外,還可在體外人工合成20~50個堿基的與基因序列互補的DNA片段,稱為寡核苷酸探針。 [1]基因組DNA探針的獲得有賴于分子克隆技術的發展和應用。要得到一種特異性DNA探針,常常是比較煩瑣的。以細菌為例,細菌的基因組大小約為5×106堿基,約含3000個基因。要獲得某細菌特異的核酸探針,通常要采取建立細菌基因組DNA文庫的辦法,即將細菌DNA切成小片段后(如用限制性內切酶做不完全水解)分別克隆得到包含基因組的全信息的克隆庫,然后用多種其他菌種的DNA探針來篩選,產生雜交信號的克隆被剔除,***剩下的不與任何其他細菌雜交的克隆則可能含有該細菌特異性DNA片段。徐匯區挑選探針推薦貨源
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